Separoinnilla lietelannasta erotetaan toisistaan kuiva-aine ja neste. Erotetun nesteen ja kuiva-aineen ravinnepitoisuudet ovat erilaiset ja separoinnin avulla ne voidaan kohdentaa paremmin peltojen lannoitukseen. Nestemäisessä jakeessa on valtaosa separoidun lannan typestä, kun taas fosfori on kiinteässä jakeessa. Lannan fosfori on yleensä lannan levittämistä rajoittava tekijä ja se lisää lannan kuljetustarvetta pitkienkin etäisyyksien päähän. Separoinnilla saadaan nestejakeen typpi-fosfori-suhde paremmaksi ja täten hehtaaria kohden nestejaetta voidaan levittää enemmän, kuin raakalietettä. Separoitu nestejae levittäytyy pellolle helpommin, arviolta jopa 30 % nopeammin, kuin käsittelemätön lanta.
Kuivajae tarvitsee oman katetun kiinteäpohjaisen varaston. Kiinteä aines, jonka kuiva-ainepitoisuusprosentti on vähintään 30, voidaan nitraattiasetuksen mukaan ajaa pellolle aumaan neljä viikkoa ennen levitystä.
Separoinnin jälkeen lannan kuiva- ja nestejakeet voidaan varastoida erillisissä varastoissa tai levittää peltoon, mikäli ajankohta tämän sallii. Separoitua lantaa voidaan käyttää myös kuivikkeena. Nestemäisen jakeen voi myös syöttää takaisin raakalietteen sekaan ja kuivan lannan tarvittaessa voi tarvittaessa kompostoida. Separaattori erottaa kuiva-aineen naudan lietelannasta paremmin, kuin sian lietelannasta, koska naudan liete on rakeisempaa.
Separaattoreita on kahta erilaista. Kiinteän separaattorin voi asentaa navetalla esimerkiksi kokoojakouran tai välikaivon yhteyteen. Toinen separaattori on liikutettava separaattori. Sen käyttö edellyttää varastotiloja raakalietteelle, erotetulle kuiva-aineelle sekä nesteelle.
.